2011年以来，作为山东省协同创新中心的主要组成单位，药学院与北京大学、南京医科大学、中山大学、山东云门药业等进行了神经退变疾病防治药物的中试和产业化合作；青岛大学药学院作为青岛市生物医药公共研发服务平台和蓝色生物医药产业园的骨干单位，与园区内50多家生物医药科技企业进行产学研合作；青岛大学药学院与上海新生源集团开展项目合作，签订13项合作开发意向；青岛大学药学院还与广州汉光医药公司、长春瑞德医药科技有限公司、青岛福生食品有限公司、青岛倍诺生物医药研发有限公司以及大连棒棰岛海产股份有限公司等进行了多项研发课题的合作。